簡介
是人體掌控各組分能量完美融合所產生的一種能量，所有人都擁有查克拉。是施展忍術、幻術、體術或製成線狀捆綁對手或切斷同為查克拉所構成的物質的能量來源。
這種的能量的組成來自於生物體內的「身體能量」和「精神能量」，提煉出查克拉後就能通過「結印」來發動不同的「術」。
由於查克拉源自身體能量和精神能量，消耗大量查克拉時人也會感覺到非常疲憊，如果在查克拉所剩無幾的情況下強行施展忍術透支查克拉，不僅有可能無法成功施術，甚至會有生命危險。
提煉查克拉也是需要一定技巧的，如果技巧不佳，不僅會導致在施術過程中浪費多餘的查克拉，術的效力也會打折扣。
而尾獸的查克拉無論是質與量都遠在一般忍者之上。
動畫中大部分角色的查克拉以藍色體現（原作中鳴人常態的查克拉是金黃色，動畫則也統一為藍色），人柱力使用尾獸力量時則為紅色。
此外，李洛克雖然不會使用忍術，但他並非沒有查克拉，他能夠使用查克拉的基本應用，例如牆壁行走和水上行走，也能夠使用解放體內查克限制「八門」的體術奧義「八門遁甲」。
基本應用
將一定量的查克拉聚集在手掌、腳掌就能產生吸附力，使忍者可以在樹木、牆面和天花板等地方行走，查克拉控制能力差的人，則無法在太過濕滑的地方產生吸附力。
更進一步則可以在水面上行走，但需要更高的查克拉控制技巧。而通過將查克拉聚集在身體的一點，也能夠在一瞬間提高肉體的爆發力。
一般忍者能夠做到從身體局部釋放查克拉，而日向一族的柔拳甚至可以從全身的穴位釋放出查克拉，寧次曾經通過持續釋放大量的查克拉來感應鬼童丸射出的箭矢，但這樣做對身體的負擔也很大。
性質變化
查克拉具備基本的七種性質，分別是火、風、水、土、雷、陰、陽。
- 火：能夠產生高溫，燃燒物體。和風遁結合威力會增加。剋制風遁，被水遁剋制。
- 風：能夠強化切割力。適合附加在武器上增加威力。剋制雷遁，被火遁剋制。
- 水：能夠產生和操縱水的形態。剋制火遁，被土遁剋制。
- 土：能夠改變物體的硬度、重量，也可以生成和操縱岩土。剋制水遁，被雷遁剋制。
- 雷：能夠產生電流，注入人體以造成麻痺效果。附加在武器上可以提升威力。剋制土遁，被風遁剋制。
- 陰：利用精神能量，能從無中創造出物質形象。幻術、奈良一族的影子忍術屬於此類。
- 陽：利用身體能量，將查克拉或意志注入無機物，使其擁有生命。醫療忍術、秋道一族的倍化術、犬塚一族的擬獸忍法屬於此類。
在學會性質變化前的查克拉都是無屬性的，通過特製的查克拉試紙可以測試出查克拉屬性，不同的屬性試紙的反應會截然不同，火則會燃燒、水則會浸濕、風則會切開、土則會粉碎、雷則會起皺。通常忍者天生只有一種查克拉性質，且這個性質會是持有者最擅長的屬性，對特定的屬性越擅長，能夠使用的對應忍術的等級也越高。通過後期的修行則能掌握兩種以上的性質變化。
而能同時融合2種以上的查克拉性質，則能夠衍生出新的性質，掌握「血繼限界」或者「血繼淘汰」，同時融合7種查克拉性質，則是達到「血繼網羅」的境界。
形態變化
顧名思義，改變查克拉的流動形式和形態，其中以螺旋丸和炎遁·加具土命最具代表性。通常遁術可以在性質變化中加入形態變化，例如卡卡西的千鳥就是先使用性質變化釋放雷遁查克拉，再用形態變化使其以放電的形式呈現，而在形態變化的忍術中加入性質變化難度就會大幅度增加，鳴人的「風遁·螺旋手裡劍」就是在無屬性的螺旋丸中加入了風遁的查克拉性質誕生。
鐵之國的武士可以通過在刀上釋放查克拉進行形態變化，使出帶查克拉的斬擊或者用查克拉構成其他武器的形狀。傀儡師可以將查克拉形態變化為絲線狀態，用來操縱傀儡。
人柱力的最大奧義「尾獸玉」以及波風水門以「尾獸玉」為靈感開發的忍術「螺旋丸」也是形態變化的一種。
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