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故事的一切要從這個世界日漸緊張的局勢談起——
在當時,一些不滿於財產分佈不均的人建立了恐怖組織,而為了應對恐怖組織,各國設立了反恐怖分子組織。而兩個陣營間的對立也在不斷加深。為了防止在對抗恐怖分子時產生過高的軍事損耗,在美國政府的主導下,秘密展開了一項能夠用於鎮壓恐怖分子,將人體能力提升至極限的超級戰士計畫。而這個計畫的負責人是一個名叫Rex的研究所所長。然而,儘管付出了大量的人力物力,Rex博士日以繼夜的研究卻沒有什麼進展。
就在研究一籌莫展之際,博士收到了一封匿名的信件,信件裡提到了在歐洲一個名叫喬治鎮的地方發生的「屍體行走」事件,信件裡還詳細標記了具體位置。Rex博士認為這是一個千載難逢的機會,而自己也不想再讓計畫擱置太久。因此他派遣了一隊研究人員前往喬治村,並著手調查這個鎮子。
有謠言說,在20世紀初,這裡曾來過一支狂熱信仰著女巫和火的秘密宗教團體,他們計畫在這裡舉行集會,而當地政府為了藉此鞏固自己的權力和發言權,對這支宗教團體進行了拷打和屠殺。然而不知是否是因為他們的怨氣未能消散,這些被屠殺的屍體散發出一種惡臭,並變異出了一種未知的病毒。這種病毒會利用宿主的身體進行傳播,而為了尋找新的宿主,這些宿主會本能地去攻擊並感染其他人來擴散病毒。為了不讓病毒擴散,歐洲聯合政府在嚴密的控制下對該區域實行了完全封鎖。
然而,研究人員還是成功採集了一部分樣本並轉交到了Rex博士手中,在這之後,Rex博士還在研究所的地下設施內新開闢了一處B1區域藉此繼續進行研究。
某一天,一個名叫傑西卡的記者對研究所感到好奇並潛入了研究所,同時發現了B1區域。但這麼做無疑惹惱了Rex博士,因此她被捕並成為了實驗對象……
在經過了無數生物實驗後,Rex博士創造出了一種新病毒,並且以他的名字命名為「Rex病毒 」。本以為這是超級戰士計畫的里程碑,但這些實驗體卻失去了理智並開始攻擊周圍的研究人員。而這些實驗體的表現和那封信件中提到的「殭屍」的行為十分相似。無奈之下,Rex博士只好承認了計畫的失敗,並且將這些實驗體全都封存在B1區域。
另一邊,對於超級戰士計畫反感的一批人想要阻止這項計畫,因此成立了恐怖組織AFC。與此同時,原SAS軍官出身的大衛·布萊克原本自願參加超級戰士計畫實驗,卻在目睹了無數非人道的實驗後,對政府失去了信心,因此他在和AFC組織相遇後,以提供情報為條件加入了AFC組織,轉而對抗政府。
AFC組織滲透進了研究所,殺死了無數研究人員並摧毀設施,而接到奪回研究所命令的反恐部隊和AFC組織展開了激戰。在逃生通道被堵住的情況下,AFC組織以同歸於盡的心態在研究所安放了C4並將其引爆,負責引爆C4的人正是早應被確認為陣亡的爆破天才——安娜。
然而,這些人的噩夢才剛剛開始。爆炸造成的衝擊讓一部分人墜入了B1區域,就在AFC組織和反恐部隊四目相望的時候,傳來了奇怪的尖叫,他們發現這些尖叫的來源就是B1區域作為實驗體被囚禁的「人們」。但在解救他們的過程中,他們發現了不對勁的地方——這些人的身上明明有多處可以導致死亡的嚴重傷勢,但卻依然筆直地站立著。顯然這些實驗體就是超級戰士計畫的失敗產物,被稱為「殭屍」的存在。察覺到活物氣息的殭屍們對他們進行了瘋狂的追捕,而這兩支部隊不得不在殭屍的追擊下瘋狂逃竄。
另一方面,接受到了反恐組織的求救信號,救援小組為了進入B1區域,決定通過爆炸損傷最小的C5區域進入B1區域。但此處也埋伏了大量的殭屍伏擊救援小組,就在救援小組即將支撐不住的情況下,以傑西卡為首的,在病毒實驗中倖存下來的實驗體——超級戰士們,發揮了出色的表現,成功擊退了殭屍。
事件結束後,原本包含超級戰士計畫在內的一切應該被公之於眾,但因為實驗毫無人道,除了「殭屍」這一存在被揭露在大眾視野之外,涉及到超級戰士的相關資訊都被媒體徹底封鎖了起來。而Rex博士也因為創造出了殭屍而受到了全球的譴責,實驗成果、地位、金錢,全都被剝奪了。然而Rex並不打算就此放棄,從來沒有經歷過失敗的他無法承認如今的局面,他依舊沉溺在超級戰士的研究中。由於政府切斷了對他的資金支持,而研究所也被AFC組織摧毀,因此Rex博士選擇在一座偏遠城市的工廠,以自給自足的方式進行研究。
某天,一個軍需公司聯繫上了Rex,他們對超級戰士的計畫十分感興趣,並且對Rex提出了一筆交易:他們會在財力資源上充分支持Rex,而作為回報,他們希望Rex能夠完成超級戰士計畫。對於如今的Rex博士來說這個公司的交易無疑是對他拋出橄欖枝,因此他欣然接受了這比交易,利用這筆龐大的資金助力加快了超級戰士的研究速度。
在此期間,REX的新研究所不光出現了實驗體逃離的情況,一些病毒甚至通過下水管道洩露到了城市供水系統裡。但當地的政府卻掩蓋了這一信息,對外宣稱這只是一個傳染病,並且對這種現象置之不理。結果傳染病後失蹤事件開始日益頻發。當地民眾看到了原本荒廢的工廠又開始運作,並看到有屍體出入後,上報了更上一級的政府,在派出新的調查組進行調查後,發現該工廠儼然已經成為了一個源源不斷產生殭屍的製造廠,而且在逐漸佔領該城市。政府無奈之下選擇了對城市進行完全封鎖,於是病毒完全失控,並在城市內無休止地傳播,最終將一座繁華的都市變異成了「失落之城」。
事後,政府雖然嘗試過派遣監視部隊調查過這座城市,但很快就失去了聯繫。與此同時,為了抵抗殭屍,反恐部隊開始不斷招募部隊組建一股「反殭屍」部隊,並且組建了Aegis研究所,這座研究所成立的目的有兩個:一是為反殭屍部隊開發能夠有效反制殭屍的兵器,二是研究能夠淨化病毒的方案。
與此同時,失聯的調查小隊深入到了工廠內部,他們發現了Rex博士驚人的研究進度,並準備上報上級,但這時他們才發現他們的通訊網絡早已癱瘓,整個調查小隊被困在了實驗室裡。雪上加霜的是,調查小隊遭遇了已經完成但仍未向外公開的新型感染體。好在經過一段時間的血戰,調查小隊最終還是切斷了工廠內的所有電力成功炸毀了工廠。但殭屍卻依舊沒有停止湧出,並且調查小隊也徹底失去了聯繫。為了拯救倖存者並調查情況,政府派遣了以安德烈為首的先遣小隊嘗試進入城市進行調查。
抵達失落之城的先遣部隊從一開始就遇到了麻煩,首先是無線電突然出現了莫名的故障,隨後直升機遭受了來歷不明的襲擊,情急之下先遣部隊迫降在了城市中,而噪音將城市中大量的殭屍吸引了過來,先遣部隊不得不在城市中抵禦殭屍的襲擊。
擊退了殭屍後,先遣部隊在一座廢棄建築內重新進行整頓,發現無線電的故障並非意外,有人在試圖阻礙他們的調查。隊員們嘗試和政府取得聯繫時,突然感覺到了奇怪的動靜,隊員們趕去後卻發現沒有任何人影,只有一個用途不明的電波裝置,而電波裝置的信號瞬間將大量殭屍吸引了過來,儘管先遣部隊立刻調整狀態迎擊殭屍,卻依然無法阻止隊員一個接一個的被感染死去。
就在安德烈以為一切都要就此結束時,一陣震耳欲聾的咆哮聲讓殭屍停止了攻擊並撤離了現場。而重新出現在安德烈面前的,是Rex博士本人。
Rex對著安德烈滔滔不絕地表示自己就是這次殭屍事件的主謀,自己可以控制殭屍等等,而之所以會口無遮攔地將一切告知給安德烈,二人都心知肚明,知道真相的人是不可能活著出去的。
隨著Rex博士的重新下令,殭屍們再次蜂擁而上,在Rex博士的冷笑中,先遣部隊的所有成員迎來了自己的結局……
就在先遣部隊抵達前不久,一名名為「索伊」(註)早期版本在每日任務頁面中翻譯為「曉兒」,後改為現譯名的研究員正在昏迷之中醒來。
索伊並非是一般的研究員,她曾經憧憬著作為科學家的Rex博士,並且加入了他手下的研究所成為了首席研究員,而Rex博士也對她百般信任。但索伊見識到了超級戰士計畫推進期間的各種殘忍手段,反對博士的所作所為。結果自己也差點成為實驗品之一。在某天索伊與Rex博士爭論期間,恰巧爆發了生化研究所爆破事件,此事件導致索伊陷入昏迷。
醒來後的索伊發現自己正身處一間不知名的病房內,剛甦醒的她並不知道發生了什麼事,滿腦子只剩下一個念頭:找到Rex博士,但就在逃出醫院的途中索伊卻發現此處屍橫遍野,並且出現了大量的殭屍。曾經與Rex共事過的索伊立馬就認出了這是Rex的產物。索伊利用之前從Rex那邊得知的殭屍弱點一邊與殭屍進行著周旋一邊試圖逃離,同時她也取得了病毒樣本希望可以製作疫苗以遏制病毒的進一步擴散。在行進至停車場時索伊恰好從旁邊死去警察的對講機中收到了發布的居民撤離通知,之後索伊利用遺落的警方的武器裝備成功逃離。
成功出逃後索伊發現這是位於失落之城的一間醫院,與此同時對講機那邊也傳來了撤離點位於加油站的消息。索伊一路在已經變成死城的城市街巷中穿梭一邊小心清理著遊蕩的殭屍,最終發現加油站已經變成一片火海,只能返回並移開旁邊擋路的軍火店卡車以另找出路。
就在索伊走到軍火店附近時,恰好看見政府的先遣小隊正搭乘直升機進入失落之城,索伊試圖呼救但沒有得到回應,只能另尋他路,在尋找公園的排水閥時索伊也得知了政府準備隔離城市。在排空公園水池的有毒廢水後索伊找到了公園後門的鑰匙取得滅火器後澆滅了軍火店門前的大火,但軍火店大門緊閉,索伊只能從旁邊的建築跳到軍火店樓頂,但軍火店也已經失守只剩下滿地屍骸。幸得內部槍械彈藥充足索伊才得以突破殭屍包圍從軍火店後門離開。
在離開軍火店後已是黑夜,索伊此時饑渴交加,只能從附近的餐廳中尋找食物。就在離開餐廳後索伊從對講機中得知政府準備下令對城市進行空襲。當索伊走到附近的一處建築工地後政府恰巧在此時發動了空襲,意識到時間不多的她立馬加快腳步,利用起重機逃離了工地來到了附近的一座公園。
在逃亡的路上索伊發現公路已經被完全堵塞,而第二輪空襲即將到來,碰巧附近居然存在一位倖存者,索伊希望他能帶走自己。在索伊聽從倖存者的指示用水箱滅掉路面上的大火時,突然遭到殭屍的攻擊,千鈞一髮之際那位倖存者及時趕到將襲擊索伊的殭屍全數殺死。原來這名倖存者是此前在Rex研究所見到過的AFC組織成員:大衛·布萊克。大衛深知索伊與Rex不是一路人,因此願意將索伊救出失落之城,最終兩人冒著空襲的風險一同逃出了失落之城。
失落之城事件後,索伊向政府自首,承認了自己要對超級戰士計畫負起一定的責任,得到了政府的認可,並且為瞭解決殭屍危機,加入了Aegis研究所。而大衛·布萊克則回到AFC組織繼續活動。
索伊的加入對於Aegis研究所來說簡直是雪中送炭,作為Rex研究所的原首席研究員,索伊的知識為Aegis研究所的大量項目作出了傑出貢獻,甚至完善了Aegis研究所最新研發出的代號為【Skull】的第一批反殭屍武器,在日後對抗殭屍的戰鬥中發揮了極大的用處。
由於大衛·布萊克救出了包括燻以及索伊在內的一部分倖存者,因此他在倖存者之間名聲大噪。但大衛認為,燻這個孩子比較特別,他的直覺認為燻能活下來並不是單純因為運氣好,而是有什麼特別的理由。在此之後,燻也跟隨大衛加入了AFC的陣營中。
另一方面,由於政府遲遲沒能收到先遣部隊的聯繫,維克特組建了一支部隊投入了戰鬥並嘗試搜尋先遣部隊,但當他們趕到時,先遣部隊已經全軍覆沒。
通訊兵費雷斯在安德烈的屍體上找到了他臨終前還帶著的手冊,上面記載了他們來到失落之城後所記載的一切資料,這本手冊也成為了維克特的部隊追蹤Rex博士的線索。
但當他們攻入到偽裝成普通建築的研究所時,Rex博士釋放了尚處於實驗階段的異形鬥獸襲擊維克特的部隊,既是為了消除入侵者,同時也是為了測試這類新型實驗體的實力。
只是和先遣部隊不同,維克特的部隊配備了Aegis研究所所研究的用於針對殭屍的【Skull】系列武器,因此異形鬥獸沒能阻止維克特的部隊,被成功擊殺。
在擊斃異形鬥獸後,以維克特為首的一部分隊員從異形鬥獸的屍體上提取了樣本準備返回,而另一部分隊員則準備作為進攻部隊深入到研究所內部。
就在打開研究所的大門的同時,進攻部隊收到了來自情報局的崔智雲上尉的撤退命令。但進攻部隊隊長認為,好不容易才滲透到研究所內部,如果現在撤出去,很可能會失去解決這場殭屍危機的線索。
就在進攻部隊隊長思索是否要違抗命令時,崔智雲上尉突然傳來了一道秘密通訊:在進攻部隊隊長匯報了他們的具體坐標後,她切斷了與上級的通訊,並同意進攻部隊調查研究所內部,但她希望進攻部隊能夠在研究所內部的一些特定區域進行調查。
在目前的情況下,崔智雲的做法等於是公然違抗政府的命令,但進攻部隊並不知道她到底想在這裡調查什麼。在不尋常的感覺下,進攻部隊遵循崔智雲的命令對特定區域進行了搜査,最終發現了通往研究所核心設施的秘密通道。
感受到情況直轉急下的Rex博士在匆忙之下將尚未完成的奧伯恩、狄歐斯(註)國服將狄歐斯誤翻為狄米歐,且迄今仍未修正、急速型異形鬥獸釋放了出來試圖阻攔進攻部隊。但由於這些實驗體尚未完成,奧伯恩和狄歐斯無視了指令嘗試逃脫城市。只留下了急速型異形鬥獸留在通道口阻截進攻部隊。好在勢單力薄的急速型異形鬥獸無法抵擋住進攻部隊持久的火力,進攻部隊最終成功擊斃了急速型異形鬥獸,並提取了血液樣本。
儘管研究所內的急速型異形鬥獸成功被消滅,但另一邊的情況卻不怎麼順利,雖然狄歐斯和奧伯恩在一處建築工地內成功被另一支部隊包圍住,但奧伯恩卻在這時吞噬了本應是同伴的狄歐斯,並衝破了這支部隊的包圍網。
想要在這種情況下捕獲奧伯恩已經不可能了,因此針對奧伯恩的捕獲作戰被迫改為殲滅作戰,這支部隊最終在建築工地擊殺了奧伯恩,徹底終結了失落之城的噩夢。此後政府下達了空襲命令,整座失落之城被夷為平地。
在異形鬥獸被擊殺後,維克特負責率領一支小隊護送異形鬥獸樣本,考慮到此次任務的首要目標是將樣本安全送達,因此維克特選擇了通過不會有殭屍出現的沙漠地帶進行迂迴。然而在小隊行進到沙漠地帶後,突然遭受到了來歷不明的砲火襲擊,小隊不得不撤進一座廢棄建築。好在樣本依然完好無損,但他們此刻也面臨著被圍追堵截的危險。根據偵查部隊所報告的信息,襲擊他們的並不是殭屍,而是一支由重火力步兵和空降兵組成的神秘部隊。儘管不知道這支部隊的身份以及他們是如何發現護送小隊的蹤跡的,但顯而易見的是這支部隊明顯是盯上了異形鬥獸樣本。
權衡利弊後,維克特當即下令兵分兩路,維克特以及大部分小隊成員會繼續護送樣本撤離,而第三分隊則留在廢棄建築中假裝保護樣本牽制住這支神秘部隊的進攻。事實證明維克特的判斷是正確的,這隻神秘部隊果然認為樣本還留在第三分隊手中,因此他們沒有注意到護送小隊的撤離。然而在和神秘部隊進行了漫長的交戰後,一架RAH-66科曼奇武裝直升機突然出現並支援神秘部隊攻擊第三分隊。好在第三分隊靈活利用了建築中的掩體,配合空中掩護成功擊落了這架科曼奇,並逼退了神秘部隊。
這次行動對於護送小隊來說無疑是打了一記強心劑,而第三分隊很快傳來報告,他們對科曼奇上遺留下來的黑匣子進行了解析,雖然完全解析還需要一點時間,不過目前已經解析出了敵人的身份,襲擊他們的部隊是由一個名叫先驅者的公司所派遣的精銳部隊。而這支部隊很顯然已經提前得知了他們的行動細節,否則是不可能在荒無人煙的沙漠地帶對他們發動精準打擊的。
不過,第三分隊給護送小隊帶來的喜悅並沒有持續太久,因為先驅者公司又發現了真正護送樣本的小隊,因此他們再次派出大量精銳部隊嘗試包圍維克特等人並強行奪走樣本。而維克特的護送小隊在和第三分隊匯合後不得不選擇正面突破先驅者的包圍圈。只是先驅者完全沒有打算放棄對他們的進攻,為此甚至不惜將第二架科曼奇部署在了護送小隊附近。但這架科曼奇也被護送小隊擊落,而撤離部隊的V-22魚鷹也及時趕到預定地點,準備接送維克特的小隊撤離。
然而,先驅者的增援部隊依然緊緊黏著維克特的部隊不放。如果讓增援部隊追上他們,那麼運載他們的魚鷹也會有危險。因此一支小分隊自願留下,並部署在了附近的一座古堡內將所有先驅者的增援部隊攔在了河岸對面,成功掩護護送小隊衝出了先驅者的包圍網。
護送小隊在逃離沙漠城市後不久,在空中遭到了大量先驅者無人機的攻擊,面對此狀況小隊成員只能在維克特的帶領之下在飛機內部朝外射擊以保護飛機不被擊落。
但所幸天無絕人之路,就在此時恰巧在飛機下方路過的武裝列車烈焰號收到了維克特發出的求救信號,車上的紅色蜥蜴傭兵團團長吉姆在得知維克特的困難之後決定出手相救。然而現在還有兩個壞消息:首先從目前的情況來看,即使斷後小隊牽制住了先驅者的增援部隊,他們的行蹤也依然被先驅者掌握著;其次,周圍湧出的無人機數量實在是過於龐大,吉姆認為出現這種規模的無人機部隊,唯一的可能就是他們在護送小隊附近部署了一架大型空中作戰單位。
果不其然,一台搭載著大量無人機的武裝魚鷹隨後出現在了眾人的視野中並不斷投放無人機,不過護送小隊還是暫時將武裝魚鷹的攻勢給逼退,並且得以成功降落在烈焰號上,而先驅者的地面部隊則通過其他列車對烈焰號發起了攻擊,但在護送小隊與紅色蜥蜴的傭兵合力之下擊退了先驅者的進攻,在之後順利摧毀了席捲而來的武裝魚鷹,並且回收了武裝魚鷹上殘留的無人機數據。
維克特在吉姆的口中得知原紅色蜥蜴傭兵團的二把手諾曼為了先驅者提供的巨大利益而背叛了傭兵團加入了先驅者並成為了先驅者的作戰參謀,而他在加入先驅者後做的第一件事就是拿自己的老東家當投名狀,在諾曼的指示下先驅者除了追擊維克特的護送小隊以外還對傭兵團駐地——一座沙漠車站發起了攻擊。儘管護送樣本的任務依然是重中之重,但吉姆對維克特他們有救命之恩,因此維克特答應幫助吉姆擊退先驅者的攻擊,而作為交換吉姆也答應事成之後傭兵團將會與政府達成合作關係。在稍作整頓後,眾人在沙漠車站中建立了防線,不斷抵禦先驅者的部隊。
面對久攻不下的沙漠車站,諾曼逐漸失去耐心,將尚處於開發階段的XT-300機甲部署在了車站中準備將吉姆等人一舉拿下,但最終XT-300被護送小隊擊破,出師不利的諾曼只能暫時退兵,而護送小隊代表政府與吉姆達成合作後繼續踏上行程,吉姆則繼續駕駛烈焰號馳騁在軌道上。
在與吉姆分道揚鑣後,維克特繼續帶領護送小隊進行異形鬥獸的樣本運輸任務。然而,先驅者的部隊再一次包圍了他們,並且作為作戰參謀的諾曼在這次包圍行動中首次出現在了維克特的面前。他向維克特保證,只要維克特願意交出樣本,就會給留給他們作為俘虜的尊嚴。然而從吉姆那裡聽說過諾曼背叛事跡的維克特打心眼裡瞧不起這個甘願當叛徒的卑鄙小人。就在二人僵持之際,支援部隊發現了維克特等人的坐標,在判明維克特等人的身份後,對諾曼等人進行了轟炸,並成功幫助維克特的部隊逼退了諾曼的部隊,可諾曼似乎並不擔心這次的失手,反而自信滿滿地打算瞧瞧維克特的「好運」能維持多久。
不論如何,支援部隊的攻擊總算是給了護送小隊喘息的機會,讓他們得以繼續前進。由於在之前和先驅者的作戰中分出了一支狙擊小隊攔截先驅者的增援部隊,因此維克特決定和這隻狙擊小隊在預定地點匯合。
然而,意外從這一刻開始接二連三地出現在了他們的身邊:首先是一隻神秘的怪物在他們前往匯合地點的路上不斷地在阻撓他們,然而這隻怪物和之前他們迎戰的先驅者部隊截然不同,不僅沒有什麼精密裝備,攻擊方式甚至和殭屍幾乎別無二致;其次,在抵達匯合地點後,他們發現在這裡待命的狙擊小隊遭遇了襲擊全員陣亡,維克特他們只能忍痛回收他們的狗牌和裝備,並且向總部進行呼救;然而收到呼救訊號後,之前還在幫助他們的支援部隊突然一反常態對維克特所在的區域實施了無差別轟炸,而總部的通訊竟然表示「對我軍造成的任何傷亡一概不過問」;更蹊蹺的是,維克特的好友兼現任國安局首席輔佐官的伊芙琳不斷頂著信號幹擾的狀態和維克特通訊,懇求維克特停止前進,並且表示狙擊小隊的全滅並不是偶然而是有人蓄意為之。但維克特的同期兼好友,同時也是現任國安局局長的陳先生隨後掐斷了伊芙琳的通訊,以老朋友的身份警告維克特【不要再固執地下達愚蠢的命令了】。突如其來的一切讓維克特等人很不解,但至少有一點可以肯定的是,有什麼人在暗中誘導維克特他們一步步邁入現在的情況。
而在抵達原定的撤離地點後,諾曼帶領大量XT-300包圍了維克特等人,除了維克特,所有的小隊成員都因為被諾曼下達了擊殺命令而被XT-300射殺。維克特十分悲痛卻又無可奈何,而當陳先生出現在他面前時,他才意識到這一切都是他的這位老朋友在暗中搗鬼。隨著XT-300押送維克特並將其囚禁起來,這次異形鬥獸的樣本護送行動也以失敗告終——小隊幾乎全軍覆沒、先驅者公司最終得到了異形鬥獸的樣本開始相關研究、就連作為國民英雄的維克特也在這次行動後對外宣佈失蹤…
事實上,陳先生為了自己的利益,私底下和諾曼達成了一筆交易,維克特的行蹤也是陳先生故意洩露給諾曼的,這也可以解釋為什麼維克特他們明明選擇了通過沙漠路線迂迴卻一直在遭受先驅者部隊的精準打擊,因為從一開始護送小隊的所有行蹤和決策就就都暴露在了先驅者的眼皮底下。
然而,陳先生的如意算盤並沒有持續太久——在得知維克特失蹤的消息後,伊芙琳向上級舉報了陳先生的通敵行徑,陳先生因此被逮捕,並供出了維克特被囚禁的地點。伊芙琳在索伊的協助下火速派出營救部隊部隊趕到了現場救出了飽受折磨的維克特。不過諾曼他們早有準備:原先追擊維克特的那隻神秘怪物被定名為The·O,並且安裝了先驅者公司提供的裝甲作為囚禁維克特場所的「看門人」。但在營救小隊的努力下,即使有著先驅者技術的加持,這個怪物也還是被成功擊斃。之後,索伊也見到了維克特,對於索伊他們的協助能夠讓自己的戰友們安息,維克特的內心只有感謝。之後,為了報答索伊他們,維克特加入到了索伊的團隊中。
只是,維克特還是不明白:為什麼曾經的朋友會為了利益去和諾曼同流合汙。因此在這次事件結束後,維克特決定當面質問陳先生,不論如何都要問個明白。然而隔天,維克特只看到了陳先生冷冰冰的屍體——他在維克特被救出後的隔天就被人秘密謀殺,就好像是有什麼人想要堵住陳先生的嘴一樣……
一年後的某一天,加勒比海的某個島嶼上持續發生了失蹤事件,政府認為這可能只是恐怖組織為了金錢而製造的人質事件,因而沒有過多注意這件事,但這座島嶼突然間失去了聯繫。這情況和一年前的失落之城事件簡直如出一轍。政府認為這絕對不是什麼巧合,Rex博士很可能就藏匿在島嶼上,因此政府派遣了LS特種部隊,分成Alpha、Bravo、Charlie三支小隊前往這座島嶼搜索Rex博士的信息,而負責給LS特種部隊提供信息簡報的,則是現任Aegis研究所成員的索伊。
然而,搜査過程並不順利,先行登陸島嶼的Charlie小隊遭到了擠滿島嶼的殭屍的伏擊,Bravo小隊則在後續探索森林的過程中遭到了不明怪物的伏擊,對此毫不知情的Alpha小隊雖然抵達了小島的中心區域,但沒有找到任何有關Rex博士的線索。就在準備撤離之時,襲擊Bravo小隊的真兇出現在了Aplha小隊面前——原來是一年前曾在失落之城出現過的,和代號「狄歐斯」的大型怪物十分相似的個體,從造型上看這隻狄歐斯尚處於原型階段,雖然還沒完全進化完成,但依然具有較高的威脅。Alpha小隊不得不和狄歐斯進行周旋。所幸尚處於原型階段的狄歐斯並沒有特別強大的戰鬥能力,因此很快在隊員們的火力壓制下表現出了虛弱狀態。索伊認為這是能夠捕獲狄歐斯的大好機會,而就在Alpha小隊試圖進行捕獲時,狄歐斯突然再次活動起來,將Alpha小隊逼退後獨自逃離了現場。
儘管狄歐斯逃出了Alpha小隊的包圍,但剛才的戰鬥無疑使其元氣大傷,索伊認為不能錯過這個機會,因此本部希望Alpha小隊繼續追蹤狄歐斯並嘗試將其捕獲。
然而狄歐斯這種在陷入危機時不選擇和敵人死戰到底而是選擇撤離的做法在迄今為止目擊到的大型突變體中也是首例,因此本部也提醒Alpha小隊:雖然首要目標依然是捕獲,但如果出現了意料之外的情況,允許Alpha小隊就地殲滅狄歐斯。
Alpha小隊根據狄歐斯的蹤跡追蹤到了一處下水道,並發現了正在療傷的狄歐斯。然而此時卻出現了大量的殭屍圍攻Alpha小隊,因此Alpha小隊不得不暫時中斷追捕行動就地展開防禦。而狄歐斯不僅藉助喪屍圍攻Alpha小隊的間隙撤出了包圍網,甚至利用下水道的各個死角對Alpha小隊展開了突襲。雖然Alpha小隊最終還是成功存活了下來,但狄歐斯卻在這次的戰鬥中逐漸發生了變異,並且破壞了下水道再次潛逃。
實際上,狄歐斯是故意將Alpha小隊引誘到下水道中,為的就是在這個對Alpha小隊完全不利的空間中將其一網打盡。雖然計畫沒能得逞,但因為下水道的破壞Alpha小隊也遭受了不小的損失而不得不原地休整。
這次的行動向所有人都揭示了狄歐斯的恐怖之處:與曾經遭遇的大型突變體不同,現在的狄歐斯已經成長成了一個具備高度智慧的大型突變體。在這種情況下,不要說捕獲狄歐斯了,就連將其殲滅也變得十分困難。因此Aegis研究所決定放棄捕獲狄歐斯,重新制定針對狄歐斯的殲滅行動。
由於這次行動的損失,LS部隊的隊長決定組建Delta部隊,和Alpha部隊一同進行追捕狄歐斯的行動。
Aegis研究所在Alpha小隊的下水道一戰後,重新制定了狄歐斯殲滅行動的具體規劃:Delta部隊會攜帶一種能夠吸引殭屍的特殊信號波發射裝置——Z誘餌,將狄歐斯吸引到島嶼中的一座廢棄工廠,隨後Alpha部隊再和Delta部隊合力擊殺狄歐斯。
然而,Delta部隊再運送Z誘餌的攻擊中突然遭受了不明怪物的襲擊而全軍覆沒。雖然不明白髮生了什麼,但Alpha小隊只能被迫接過Delta小隊的任務,將Z誘餌回收並投放到指定位置,並來到了原定的廢棄工廠。
結果被吸引而來的不是狄歐斯,而是一種名叫炎魔的新突變體,很顯然Delta小隊的全滅和它離不開關係。炎魔的火焰能力對Alpha小隊造成的嚴重的傷害,所幸索伊發現可以利用工廠周圍的管道排放的冷卻液壓制炎魔的火焰,Alpha小隊憑藉這個特性成功擊殺了炎魔。
炎魔操縱火焰的能力也給了Aegis研究所靈感,開發出了繼SKULL系列後的又一種針對殭屍的Balrog系列武器。
只是,這次行動的最終目的依然沒有達成:Delta小隊因為炎魔的襲擊導致全軍覆沒;而不管狄歐斯和炎魔之間有什麼聯繫,炎魔都或多或少幫助狄歐斯牽制住了Alpha小隊的步伐,讓其得以再次從眾人眼皮子底下溜走。
而世界外面的情況也不容樂觀:雖然人類的武器在日漸進步,但病毒也是如此,以Z病毒為首,有一部分殭屍已經不只能靠啃咬來傳播病毒:有一些殭屍在自身內部進化出了大量爆炸性物質,並且通過自爆的方式擴散病毒;也有一部分殭屍能夠將手臂延展至不可思議的距離來貫穿人類進行感染(註)腐化暴君、痛苦女王;還有一部分殭屍甚至能夠通過主動注射藥物來強化自身的能力(註)初版痛苦女王的技能【羽化】,而之前Alpha小隊和狄歐斯在下水道周旋時所目擊到的狄歐斯身體的異變,意味著狄歐斯很大機率也感染了Z病毒。
為了躲避Alpha部隊的追捕,狄歐斯正在進行更進一步的進化。根據線索,Alpha小隊追查到了一座廢棄建築,卻發現狄歐斯已經包裹在蟲蛹中並開始進化。
由於蟲蛹十分堅固,常規武器甚至無法造成任何損傷,因此Alpha小隊決定在建築內安放C4,在狄歐斯再次甦醒前利用建築倒塌的衝擊力砸碎蟲蛹。
但就在抵達頂部時,Alpha小隊發現這實際上是一處被隱藏起來的研究設施,考慮到殭屍進化的核心數據可能就在這裡,索伊請求小隊收集研究所內的數據。Alpha小隊最終成功回收了所有數據,並在C4爆炸前撤離了建築。
然而因為搜索資料的緣故,Alpha小隊錯過了最佳的爆破時機,讓狄歐斯得到機會從蟲蛹中徹底甦醒,突破了廢棄的建築,而此時的狄歐斯的身型已經徹底蛻變完成,因此它的代號被重新定名為惡之根源——安格拉。
此時的安格拉已經沒有了逃跑的想法,它決定在這座建築外圍徹底將Alpha小隊剷除再飛出島嶼。為了不讓安格拉離開島嶼,Alpha小隊拼盡全力將安格拉牽制在了廢棄建築外。所幸在索伊的指引下,空中部隊及時趕來,配合空中轟炸和地面上Alpha小隊的通力合作,安格拉最終被成功擊殺,加勒比海島的噩夢也就此徹底結束。
加勒比海的狄歐斯事件結束後,政府派遣了一支特遣隊突襲了一座先驅者的基地,回收了此前被先驅者所搶奪的異形鬥獸樣本以及研究資料。
原本任務很簡單,只要將資料和樣本運送到指定地點並轉交給運輸隊即可,然而中途有一名隊員在回收過程中不慎感染了病毒,特遣隊的運輸機不得不進行迫降,而倖存下來的隊員也勉強抵達了指定地點,將樣本裝上了運輸隊指定的列車。
特遣隊的領隊傑拉德正在等待運輸隊的人,而隨著通信傳來,傑拉德發現交接樣本的正是【紅色蜥蜴】傭兵團的領袖吉姆。
就在二人閒聊之際,一個巨型雪怪突然出現在傑拉德等人面前奪走了樣本並逃之夭夭。
只是雪怪無視傑拉德等人,並且能夠精準鎖定樣本這件事實在是過於蹊蹺。實際上這一切也是Rex博士在暗中作祟。自加勒比海的狄歐斯事件後,越來越多的機關和政府開始秘密研究病毒,而這些人並不知道,他們所做的一切都是在無形間幫助Rex博士進行研究,而博士只要在合適的時機「回收」他們的研究成果即可。
早在特遣隊回收樣本前,政府的一名內部人員就已經被Rex博士收買,並洩露了攜帶樣本的隊員信息,因此雪怪得以在指定地點待命並奪走樣本。
只是傑拉德不會允許這隻雪怪搶走樣本,因此他們一路追蹤雪怪,最終在一片地下山洞內擊殺了雪怪,並奪回了樣本。
傑拉德和吉姆將樣本運送到了指定位置——政府機構名下的一處研究所。
但迎接他們的,卻是洶湧而來的殭屍,而這座政府機構名下的研究所只是個幌子,這其實是Rex博士的新研究所。
不明真相的傑拉德一行人被打的措手不及,只能呼叫直升機再次返回接送他們撤離。然而直升機在返回目的地後因為風雪太大而無法降落,又遭受了不明襲擊而墜毀。因而傑拉德等人不得不深入研究所進行調查。發現其中還藏匿了不少他們以前從未見過的新型殭屍。
在研究所深處擊敗了委託人派出的巨型饕餮後,眾人逃出了研究所。
只是,自上次事件後消失在大眾視野裡的Rex博士不可能獨自一人建設如此大規模的研究所,這說明除了政府之外,很有可能還有另一股大型勢力在暗中資助他。
研究所內如火如荼地在製造殭屍,還有最後看到的那個大型怪物,傑拉德和吉姆隱約感覺到了幕後黑手可能就是Rex博士,因此他們追蹤他的蹤跡來到了一處設施內,並在這裡見到了博士的真面目。
博士向眾人坦白了真相:指示他們運送樣本的其實是自己而非政府,樣本其實是用來輔助他的研究資料的存在,而他們在運送完樣本後,等待他們的只有死路一條。
雖然殭屍是超級戰士計畫中失敗的副產物,但Rex博士認為,這是人類進行進化的過程中不可避免的過程,他畢生的心願只有一個,那就是利用Z病毒成功製作超級戰士。為此博士不惜犧牲自己的兩個養女艾薇爾和奈德瑞,在她們身上進行了超級戰士計畫的實驗,並將她們派去阻攔傑拉德等人。
兩個女兒雖然保留了作為人類的意識,但本質上依然和殭屍沒有什麼特別大的區別,因此她們最終還是被傑拉德等人徹底消滅。
在這之後,傑拉德和吉姆等人繼續追蹤逃走的Rex博士的蹤跡並嘗試進行追捕,終於發現了他藏匿的最後的實驗設施並將這裡的所有實驗體和設備盡數清除。
Rex博士並不知道他們手中的武器是由自己曾經最信任的索伊協助開發的,他只知道他們的火力確實超出了他們的想像。
就在研究資料被銷毀,博士被眾人逼到無路可退時,他將多年來的研究成果注射到了自己的體內,並隨著一聲咆哮化身成了巨型怪物「邪神」。
儘管將自己曾經的諸多實驗體的能力整合在了一起,作為邪神載體的Rex博士自身卻變得極不穩定,因而在傑拉德和吉姆等人的重重圍攻下,博士再也無法承受打擊,最終被徹底消滅。
而隨著這個開闢殭屍時代的真兇的死亡,世界迎來了和平紀元……
Rex博士死去後,在政府的安排下,有關超級戰士的相關信息已徹底封鎖,包括針對媒體、研究機構、相關任務和企業的一切資訊,超級戰士也逐漸從人們的視野中漸漸淡出。而那些已經成為超級戰士的人則歸入了政府旗下秘密管轄。
只是儘管世界各地看上去迎來了和平,但暗地裡已經有無數的組織和機構在進行病毒實驗,因此政府的管轄實際已經變得毫無意義。
另一邊,如今擔任Aegis研究所所長的索伊正在對研究所進行人力資源的補充,而以傑西卡和多米尼克等超級戰士為首的人相應了索伊的號召,成為了研究所旗下的研究人員。
某天,傑西卡收到了一封奇怪的信件,而信件上赫然寫著「Rex還活著」,以及一個被準確標註出來的地點。
傑西卡將這件事報告給索伊後,索伊認為這個信息雖然看上去有點胡扯,但也不能放任不管。因此她派遣了傑西卡和一支部隊前往坐標地點進行調查。卻在中途遭到了蝗蟲群的攻擊,不得不在廢棄都市中進行調查。
而在都市中心,她們發現了一隻奇特的怪物:有著蝗蟲的身體特徵,卻能夠正常和人類進行交流的名叫「刀鋒戰蝗」的生物。
在和刀鋒戰蝗對峙的過程中,它感覺到傑西卡也是一名超級戰士,因此對其表示,如果她願意跟它一起來,那麼它就會告知傑西卡有關超級戰士計畫的真相。
但就在這時,一刀鋒戰蝗卻被某處射來的子彈給擊斃,而傑西卡等人也失去了能夠瞭解真相的機會。
傑西卡決定在城市中搜査擊殺刀鋒戰蝗的神秘人物,而在搜査過程中,傑西卡等人再次遇到了一個和刀鋒戰蝗類似的,能夠進行交流的人形怪物。
但這隻怪物卻對傑西卡表示「好久不見」。可傑西卡卻怎麼也想不出面前的人到底是誰。
發現自己已經被傑西卡遺忘的怪物很失望,並承諾一定會讓傑西卡想起自己是誰。
隨後,利用先前留下的發射器,他們追蹤到了這個怪物的所在地——一處廢棄許久的研究設施。而在設施內竟然撿到了傑西卡以前的身份證件。就在即將深入研究所進行調查時,傳來了一陣爆炸將傑西卡等人擊暈,而傑西卡回想起了曾經的記憶……
時間要到轉到當初傑西卡被Rex博士抓走成為實驗體的那段時間,當時除了她,還有一個名叫傑克的記者同伴也被抓走並成為了實驗品,對這個地方感到毛骨悚然的二人決定悄悄溜走,而在逃脫過程中,他們偶然看到了索伊在和Rex博士進行爭論。博士認為殭屍現在是在逐漸進化,是人類邁向更進一步的進化中所不可缺少的步驟;但索伊認為這些殭屍沒有任何自主意識,是相當危險的存在,並不斷規勸博士放棄實驗。
二人不敢停留太久,不斷在研究所內部搜尋逃生的道路。而就在即將抵達最後的逃生口時,傑克卻被鐵閘門擋在了實驗室內部。而之前在啟動緊急電力裝置時,安娜趁著他們離開的間隙悄悄潛入了進來並安放了C4,爆炸最終將傑克吞噬,只有傑西卡一人成功逃脫。
醒來後的傑西卡終於想起了傑克,但傑克此時卻陷入了癲狂向傑西卡發起了攻擊來宣洩傑西卡「拋棄自己獨自逃跑」的不滿。只是傑克終究不是作為超級戰士的傑西卡的對手,因而受到重傷敗下陣來。彌留之際,他對傑西卡表示抱歉,自己不能再陪她走下去了,但她還有新的敵人需要面對。
傑剋死後,他身上的通訊器傳來了呼喊傑克的聲音,憤怒的傑西卡認為這可能就是讓傑克變成這樣的罪魁禍首,並不斷追蹤信號。
結果在抵達信號的所在地後傑西卡卻發現,通信的另一頭是索伊研究員。
索伊向傑西卡表達了歉意,她實際上想讓傑西卡加入一個她緊急擬定的計畫中,因此她決定讓與傑西卡有交情的傑克去和傑西卡進行溝通,只是傑克誤判的情況,最終導致了現在的局面。
就在這時,一個人形和機械結合在一起的怪物襲擊了傑西卡等人,在傑西卡將其擊斃後,索伊對傑西卡表示,如果她想知道真相,可以和自己一起上飛機,她會將真相毫無保留地告知給傑西卡。
傑西卡在登上飛機後,懷揣著複雜的心情準備聽索伊講述真相。然而在起飛後不久,飛機遭受了來自不明無人機和一個帶著翅膀狀裝置的人形生物的襲擊,因而不得不迫降在一處廢棄設施附近。
所幸設施附近有XT-300的訓練設施,因而傑西卡和索伊等人得以聯繫研究所總部。而那個生物此時再次阻擋在了眾人面前,傑西卡等人則拼盡全力將其斬殺。
在斬殺這個神秘的生物後,傑西卡不明白,它口中一直在喊著「主人」,那個主人的真實身份究竟是誰。而索伊向傑西卡揭露了真相:它口中的主人就是這一切的幕後黑手——道格拉斯財團的創始者,道格拉斯·雅各布。
實際上當初Rex博士的新研究所能有如此龐大的規模,就是因為道格拉斯財團在背後提供大量的資源協助Rex博士。道格拉斯的財團規模十分龐大,即使是Aegis研究所也無法與其抗衡。
之前直升機遭遇的來歷不明的無人機襲擊,其實是道格拉斯財團旗下的柯羅諾斯公司的傑作,他們發現了索伊知道他們的真實身份,因而嘗試消滅索伊以防止他們的計畫被打亂,為此道格拉斯財團甚至在Aegis研究所安插了不少內應。只是索伊及時發現了這個情況,並集結了不少可靠的同伴,因而道格拉斯沒有得逞。
而現在,索伊希望傑西卡能夠幫助她們共同對抗道格拉斯財團,傑西卡答應了索伊的請求,加入到了她的團隊中。
儘管柯羅諾斯旗下有大量的子公司,但由於安保十分森嚴,因此除了極少數高層之外沒有人知道柯羅諾斯總公司的情報。只是柯羅諾斯沒有料到,之前擔任過Rex研究所首席研究員的索伊恰好對這些情報略知一二。這也是她用來追蹤柯羅諾斯的基礎線索。然而這個行動無疑觸怒了柯羅諾斯,他們也曾嘗試在Aegis研究所內部安插內應嘗試破壞情報,但索伊暗中集結了不少可靠的成員擴大了勢力,因此柯羅諾斯嘗試從內部破壞的計畫沒能得逞。由於無法從索伊開始下手,柯羅諾斯最終決定處理內部可能成為威脅的人物。
某天,道格拉斯·雅各布給先驅者公司的王牌傭兵卡里託親自指派了一項任務:潛入一座研究設施竊取數據。雖然看上去並不是什麼高難度的任務,但當卡里託和一眾先驅者傭兵潛入設施後卻發現情況沒有想像中那麼簡單:先是在研究設施內意外發現了大量的殭屍,其次是在排除設施內的各種陷阱並成功上傳數據後,道格拉斯卻表示在檢查內容時發現還有遺漏,並讓卡里託等人再次上傳遺漏的內容。這種把他們當猴耍的態度讓傭兵們很不滿,但卡里託表示他們是傭兵,不能對自己的僱主表達出任何不滿,並帶領部隊繼續執行道格拉斯的任務。只是卡里託本人也隱約察覺到有一絲違和感,這一連串的事情彷彿就像是想拖住他們的腳步一樣。
即使如此,傭兵部隊也出色地完成了任務。然而還沒感受多少勝利的喜悅,先驅者基地突然傳來了被襲擊的消息,隨後卡里託等人和先驅者基地徹底失去了聯繫。
Rex博士的死亡與背後真相的公開震驚了全世界,而政府和恐怖分子在此刻互相推脫責任的時候,Rex博士的研究引發了蝴蝶效應——一些被金錢和權力迷惑雙眼的人們開設了新的研究所並展開了病毒的研究,其中就包括大型僱傭兵公司【先驅者】。
在之前先驅者公司早就通過繳獲政府護送隊的異形鬥獸樣本獲取了病毒的相關資料,雖然後面異形鬥獸樣本被政府奪回,但先驅者仍在此期間進行了部分研究並小有成果,而在Rex博士死亡後,先驅者更是在道格拉斯財團的大力支持下接過了Rex的研究工作。只是,先驅者公司缺乏安全的研究環境和安全意識,Z病毒在此期間不慎洩漏到了研究所內部。
時任先驅者作戰參謀的諾曼發現起情況不對勁時,研究員以及大部分的僱傭兵們已經變成了殭屍並在基地內發起了攻擊——因此卡里託才會在此時收到基地被襲擊的消息。雖然先驅者公司的安保措施能夠將殭屍隔離在內,但倖存者也同樣如此,因此諾曼和一部分成員只能選擇前往機庫嘗試搭乘魚鷹撤離。
但背叛了先驅者公司的一部分人趕在諾曼等人來到前駕駛最後一架魚鷹離開了先驅者公司。無奈之下諾曼只能呼叫AFC作為最後的求救手段,雪上加霜的是,原本計畫用於消滅殭屍的新式泰坦裝甲和著裝者也被感染並成為了墮落泰坦,諾曼等人只能傾盡一切火力擊殺所有墮落泰坦。
另一方面,接收到諾曼求救信號的AFC組織派遣了以大衛·布萊克和燻為首的一批精銳部隊嘗試營救諾曼,但奇怪的是,在接收到信號後,諾曼卻沒有再作出回應,大衛等人只好一邊穿過滿是殭屍的小鎮,一邊根據路線抵達先驅者基地。
然而在基地前,他們遭遇了被Z病毒感染,與裝甲運兵車結合在一起的生物兵器鐵甲巨蠍。大衛等人只好在進入基地前先解決這個大麻煩。
在消滅鐵甲巨蠍後,大衛等人成功進入了先驅者基地,但基地內的情況同樣不樂觀,而且燻在行動過程中受到了攻擊,傷勢十分嚴重,大衛等人只好將燻帶到安全區域進行治療,並牽制住來襲的殭屍。
而諾曼則決定派遣支援部隊來幫助大衛一行人。結果大衛發現,趕來的戰鬥用機甲已經完全被病毒感染,成為了破面重甲。無奈之下大衛等人只好將破面重甲也一併擊殺。
然而這其實是諾曼的調虎離山之計,在大衛等人被破面重甲牽制住的時候,天空中又飛來了一台破面重甲,將燻給劫走了。
雖然不知道諾曼為什麼要背叛他們,但大衛是絕對不會放過這個厚顏無恥的叛徒的,因此他決定率領所有成員全部深入到研究所內部去救出被劫走的燻。
隨著深入基地內部,大衛等人接收到了燻的無線信號。雖然燻表示自己在避難室裡很安全,但諾曼看上去很不正常。
原來在之前的行動中,諾曼不慎感染了Z病毒,這使他徹底失去了理智,並且莫名其妙地啟動了控制室的防禦系統,但他似乎被什麼東西吞了進去,只是還沒等燻說完,通訊就因為受到了強烈幹擾而被迫中斷。
大衛等人不能怠慢,立刻抵達了控制室附近,所幸燻還留在避難室內並無大礙,但迎接大衛等人的是已經被感染的核心控制室防禦系統,燻立刻意識到,諾曼正是被吞進了防禦系統的內部。
大衛等人利用周圍有限的地形和防禦系統進行周旋,最終成功將其徹底擊斃,並救出了燻。而隨行的AFC組織成員在此時拷貝了先驅者基地的資料,獲得了先驅者公司關於病毒的研究資料。
原來,解救諾曼只是個幌子,他們真正想要的其實是先驅者公司對Z病毒的第一手研究資料,只是,他們沒有料到,這背後牽扯到的勢力,超出了所有人的預料……
在AFC研究病毒資料的時候,意外地發現其中的主謀竟然是政府機構——原來政府表面上在強調病毒的危險性並假裝試圖遏制病毒擴散,背地裡卻在研究殭屍病毒,意圖利用病毒再現超級戰士計畫。
然而這個資料是道格拉斯故意遺留在此讓AFC獲得的假資料(註)資料是真的,但道格拉斯將與自己有關的所有信息全部篡改為政府所為。,道格拉斯意圖利用這份資料轉移AFC的注意力將鍋甩給政府好讓自己脫身。但道格拉斯沒有想到的是,另一邊正在趕回基地的卡里託卻會成為計畫功敗垂成的最大變數……
另一方面,意識到大事不妙的卡里託決定率領眾人立刻趕回基地,卻在返程中也遭遇了襲擊。而卡里託等人在搜救倖存者的過程中甚至遭到了本該守護基地的科曼奇武裝直升機的攻擊。就在卡里託等人一路與其周旋,並最終利用基地內僅存的砲台逼退卡曼奇後,等待他們的卻是另一架科曼奇的無情砲擊——道格拉斯為了隱藏自己的所作所為,將先驅者公司作為棄子徹底拋棄了。之前的任務就是為了故意將卡里託等人支開,好趁此機會將先驅者公司從內部開始瓦解。
只是卡里託等人奇蹟般的在這場砲擊中倖存了下來。道格拉斯原本還派出了旗下的特工Mrs.J試圖徹底抹殺卡里託等人,但卡里託等人懷揣對道格拉斯背叛的恨意,在絕境中拚死反擊,最終成功逼退了Mrs.J,而道格拉斯乘坐的科曼奇也在之後飛離了先驅者基地。只是這場戰鬥還是讓絕大部分傭兵都陣亡,而卡里託也在此次戰鬥中失去了一隻眼睛。
世界各地的恐怖組織活動開始日漸猖獗,其中一個名叫落日軍團的日本恐怖組織尤為突出,而且令人不安的是,有關落日軍團的活動報告中出現了大量有關殭屍和落日軍團一同行動的消息。情報局決定派遣崔智雲潛入落日軍團蒐集證據。
而在此過程中,崔智雲意外地發現了落日軍團背後有一個神秘勢力在幫助他們,但此時崔智雲的蹤跡被落日軍團的伊琳娜發現,而崔智雲為了獲取決定性的證據決定切斷和情報局的聯繫獨自調查。
而伊琳娜藉助神秘勢力旗下一個名叫Mr.X的神秘男子的力量,找到並抓獲了崔智雲,將她囚禁在了落日軍團的堡壘內部。而伊琳娜也藉此機會得以和資助落日軍團的神秘勢力領頭人會面……
另一方面,由於崔智雲屢次擅自行動,加上這次行動後失去了和崔智雲的聯繫,對崔智雲有所懷疑的情報局派遣了夢瑤去調查崔智雲。結果在暗中監視的夢瑤發現了崔智雲的清白,並且在崔智雲被抓獲後立刻展開救援行動將其救出。
雖然Mr.X率領一部分落日軍團成員出來阻截眾人,甚至成為了生化怪物,但最終還是被眾人成功擊斃,眾人得以逃出落日軍團的堡壘。
在營救崔智雲期間,崔智雲一邊對於自己的獨自行動表達了歉意,一邊向夢瑤分享了自己蒐集到的情報:實際上以落日軍團為首的恐怖組織逐漸在全球活躍並非偶然,道格拉斯財團的創始人道格拉斯·雅各布在暗中向恐怖組織資助了大量的資金,利用全世界的混亂為自己牟取利益,而不只是資金,他甚至將以殭屍為首的一些生物兵器售賣給了恐怖組織。
夢瑤認為,有必要立刻展開應對道格拉斯的計畫。而道格拉斯本人並未意識到自己的信息已經暴露給崔智雲等人,他此時正準備進行徹底隱藏自己身份和蹤跡的「斷尾」行動。此後,先驅者公司病毒洩露事件爆發,藉助此次事件道格拉斯徹底清除了已無利用價值的先驅者公司。
另一邊,在加勒比海上,加西亞艦隊的指揮官露西亞正因為暴風雨過於強烈而導致基地補給無法抵達而苦惱,而在此時他們附近的一艘補給船發出了緊急求救信號。露西亞和恩佐率領部隊抵達了補給船附近,可這艘補給船沒有任何回應,因此露西亞等人決定暫時先將補給船帶回基地。
可沒想到在深夜時分,補給船突然發生了爆炸,隨後大量的殭屍從補給船的貨倉內蜂擁而出並襲擊了露西亞等人。所幸露西亞等人反應及時,擋住了殭屍的襲擊,並且根據殭屍的襲擊路徑殺入了補給船內部,結果在補給船內發現了一個名叫Big·C的螃蟹模樣的突變個體。
在眾人將Big·C殲滅後,露西亞決定調查和補給船內的殭屍有聯繫的人員,但現場已經一片狼藉,露西亞擔心可能已經無法進行進一步的搜査。但恩佐表示他心裡有點頭緒:這艘船上搭載的補給箱上印有柯羅諾斯公司的標誌,而當初在進行海盜掃蕩戰時,恩佐也看到過完全相同的補給箱。原本恩佐認為這只是海盜們掠奪而來的戰利品,但那次戰鬥中也同樣出現了大量殭屍,令他們一度陷入苦戰。而如今類似的場面再次發生,那這就意味著當初出現的殭屍襲擊並非偶然,海盜組織和柯羅諾斯之間一定會有某種關聯。
恩佐認為,以海盜組織和柯羅諾斯有一定關聯作為前提的話,那麼就一定會有和柯羅諾斯簽約的海上運輸隊的資料,因為這種大型軍備公司沒有道理去和一介小民做單純的運送交易。如果是這樣,那麼他們要追蹤的對象只有一個——一位名叫米迦勒的女人,不僅是印度洋上最大規模艦隊的艦長的獨生女,還是有著「降臨在印度洋的死亡天使」之稱的被下達了最高通緝令的海盜。
在認同了恩佐的判斷並且確認了追蹤目標後,露西亞下令,一部分隊員留在原地進行整理,剩下的大部分成員正式展開針對米迦勒的追蹤行動。
在調查過程中,露西亞截獲了一個奇怪的信號,並派遣恩佐率領一支部隊前去調查。結果發現信號的源頭是一處港口,但是港口的內部卻隱藏著一座大型基地。
在繼續搜索的過程中,恩佐收到了來自米迦勒手下一個名叫渡鴉的男人發來的通訊,渡鴉暗示恩佐,發送信號誘導他們來到這座偽裝成港口的秘密基地的正是他,但恩佐等人想對這個地方做什麼他並不在意,他只給了恩佐一個另一處坐標並讓他和露西亞等人一同前往,因為米迦勒有要事和他們商量。
雖然不知道米迦勒葫蘆裡賣的什麼藥,露西亞還是決定等去和恩佐回合,並在聽取恩佐的詳細報告後再決定要不要去。為了幫助露西亞更快定位到恩佐的位置,他對露西亞表示,他們現在所在的港口除了有大量柯羅諾斯旗下的貨櫃,還有一些可疑的光學裝置。藉助恩佐的提示,露西亞成功抵達了港口並幫助恩佐等人消滅了此處的所有殭屍。
隨後二人來到了指定的地點,卻遇到了一些比較有意思的事:首先,道格拉斯財團資助的恐怖組織裡包含了海盜組織,並且柯羅諾斯還將一隻名叫機械巨齒鯊的海上機械生物兵器送給了海盜用於防衛。但由於道格拉斯之前在計畫隱藏自己的身份,因此柯羅諾斯暗中讓機械巨齒鯊失控並反過來攻擊海盜等人。其次,由於對這種背叛行徑十分反感,因此在坐標點,米迦勒見到了眾人並表示,海盜想要讓道格拉斯這個叛徒付出代價,而露西亞也在追查道格拉斯財團,兩股勢力可以藉此達成合作關係共同對付道格拉斯。
權衡再三之下露西亞接受了這個提議,並且以海盜和海上艦隊聯手殺死機械巨齒鯊為起點,正式達成了臨時的合作關係。
實際上,柯羅諾斯公司作為道格拉斯財團旗下的武器研發公司,開發了大量先進的兵器,而這座港口就是柯羅諾斯公司的一處偽裝基地,恩佐在這裡發現的光學裝置實際上是柯羅諾斯正在開發的一種名叫【斷域雷魂】的新式兵器,是利用在海上打撈出來的能量核心製作而成的武器。只是這個能量核心實際上是來自宇宙的神秘組織【仲裁者】的所有物,柯羅諾斯擅自利用能量核心製作武器的做法顯然讓仲裁者有點不滿,因此仲裁者派遣了阿塔尼斯和阿克塞恩,在恩佐和港口的殭屍周旋期間秘密回收了所有的能量核心。而對於恩佐等人,他們並沒有興趣去介入對於他們而言相當於低等種族的人類的鬥爭,因此在回收了能量核心後,二人就離開了這片區域。而仲裁者達成了回收能量核心的目的,也沒有再對人類進行進一步干涉。
安葬好戰友後,卡里託發誓要讓背叛他們的道格拉斯血債血償。在得知其名下的柯羅諾斯公司正在襲擊Aegis研究所後,卡里託本著「敵人的敵人就是朋友」的想法,決定前往Aegis研究所幫他們擊退柯羅諾斯公司的襲擊。
但卡里託等人晚來了一步,伊琳娜很早就收到了來自道格拉斯的指令,率領著大量XT-300攔在了卡里託等人的面前並決定將他們徹底剷除。好在吉姆和傑拉德駕駛烈焰號及時趕來將XT-300盡數摧毀,卡里託得以繼續前進,並和吉姆等人相遇。而不只是他們兩個,索伊、傑西卡、崔智雲、夢瑤、維克特,所有決心反抗道格拉斯的人都聚集在了這裡,而卡里託也加入到了這個隊伍中。
在修好烈焰號後,吉姆帶領所有人駕駛烈焰號,準備前往道格拉斯旗下的柯羅諾斯公司總部發起總攻擊。但柯羅諾斯在途中派出了大量XT-300截擊烈焰號,逼迫吉姆等人不得不啟動烈焰號的自爆程序和XT-300同歸於盡。而在眾人趕在爆炸前逃脫後,柯羅諾斯又派出了一台名叫【巨神兵】的巨型攻堅堡壘攔在了眾人面前。藉助不斷搶奪降落在戰場上的XT-300的火力,眾人最終成功將巨神兵給擊潰。只是烈焰號已經徹底報廢,因此眾人對柯羅諾斯的總攻擊以失敗告終,不得不進行戰術性撤退。
另一邊,燻自從逃離先驅者公司後就一直出現原因不明的頭痛症狀,大衛·布萊克擔心燻很可能在被諾曼抓走時進行了某種實驗,因此經過多方輾轉聯繫上了曾在Rex研究所進行研究的索伊。
索伊對燻進行了簡單的檢查後懷疑燻可能已經了一部分改造實驗,只是具體的情況還有治療方案需要有更多的研究資料作為數據支持,因此大衛和燻等人決定前往已經廢棄的Rex研究所尋找資料。
只是這一路並不順利,儘管研究所已經被廢棄了很長一段時間,內部依然藏有大量被感染者在遊蕩,而且研究所內的保全設施還在正常運作,並將眾人判定成了逃離的實驗體進行攻擊。不過最終眾人還是成功摧毀了保全設施,並且得到了研究資料的備份數據。
在離開研究所後,大衛等人來到了指定的見面地點,但是來迎接他們的不是索伊,而是傑拉德。
傑拉德先是嗆了一口曾經讓自己吃盡苦頭的「老同事」,隨後表示,索伊博士已經轉移到安全的地方了,自己留在這裡接應他們。而在轉移過程中,一個奇怪的生物突然出現並阻截了傑拉德一行人。傑拉德等人一邊逼退這個奇怪生物的進攻一邊嘗試呼叫直升機進行撤離。
大衛不知道這個怪物是何方神聖,傑拉德表示這個名叫瘋狂爆破手的傢伙是道格拉斯財團旗下的超級戰士之一,相比較Rex研究的殭屍,在保有強大戰鬥力的基礎上還留有人類的意識,但實際上性質更偏向於殭屍。
隨後索伊發來了聯絡:之前傑拉德從大衛那裡上傳給她的研究資料已經分析完畢,但不幸的是燻已經被確認也遭受了超級戰士的改造。萬幸的是燻的體內奇蹟般的產生了少量抗體延緩了改造的生效時間,但現有的資料無法徹底根除燻的改造,只能不斷服用藥物延緩改造效果,如果想要徹底根除,就需要從道格拉斯·雅各布那邊拿到更多的材料才可能有突破。
大衛下定了決心,為了能夠拯救燻,哪怕再怎麼渺小的可能性他都不會放過。因此他帶領眾人一起加入到了索伊的團隊中。
在加入到索伊的團隊後,索伊表示,也許還有一個人可以加入到他們的團隊中——就是那個此前曾獨自潛入Rex研究所並將其引爆的神秘人士。
大衛和燻等人暗中調查了這個神秘人士的蹤跡來到了一座軍工廠內,只是這時燻的頭痛再次發作,大衛不得不帶著燻在軍工廠內暫時整頓。然而此時伊琳娜突然出現在了這裡並嘗試將大衛等人封鎖在軍工廠內。
在躲避殭屍襲擊的過程中,大衛在發現了一座通訊站,並成功聯絡到了維克特,在堅守一段時間後,維克特派出了一個老朋友幫助他們脫離了危險,而這個人就是曾經和維克特一同作戰過的多米尼克,而多米尼克的身邊還跟著B-Girl的成員艾琳。
見到偶像讓燻感到很驚訝,但艾琳的情況也不樂觀——她也是超級戰士計畫的受害者之一,幸好多米尼克及時將艾琳救了出來。儘管還沒有正式加入到索伊的團隊中,但自此之後二人就一直在進行針對道格拉斯的破壞行動。而伊琳娜此時再次出現在眾人面前,並派出了又一個超級戰士阻攔眾人。但這個超級戰士很快就被眾人給摧毀,而伊琳娜也只能狼狽地離開現場。
這一次搜尋那個神秘人士的計畫因為伊琳娜這個突如其來的意外而告吹。不過,多米尼克表示他也聽說過這個人,而艾琳則表示大衛他們或許還有辦法繼續追查,只是想要知道更進一步的情報,他們可能需要去找到一個名叫【女王傭兵團】的僱傭兵組織,這個組織的首領梅麗莎一定知道些什麼。
在艾琳的帶路之下,大衛等人成功來到了女王傭兵團的駐地並會見了傭兵團團長梅麗莎,雖然這是一筆交易,但梅麗莎並沒有向大衛等人索要佣金,只需要讓他們傾聽自己的經歷即可:
原來,梅麗莎也是道格拉斯的超級戰士的受害者,而且已經趨近改造完成,而和梅麗莎一同遭受改造的還有一個名叫卡巴斯的男人,但與梅麗莎不同,卡巴斯在改造完畢時已經失去了自己的人格,成為了純粹的人形兵器。在恐怖分子襲擊研究所時,二人得以搭乘直升機逃脫,但追蹤部隊很快就將直升機擊落,二人不得不迫降在一處霓虹都市內,而迎接他們的是大量的殭屍。就在二人不斷尋找逃生路線時,卡巴爾選擇了犧牲自我讓梅麗莎得以逃脫這片人間煉獄。因為自己被改造和這次事件,梅麗莎對道格拉斯懷恨在心,並且決定加入到他們的團隊中一同對抗道格拉斯,同時也給出了關於那個名叫安娜的神秘人士的相關信息。
另一邊,由於伊琳娜屢次沒能完成指派的任務,因此道格拉斯將落日軍團視為已經失去作用的棄子,並在落日軍團的駐點利用巨噬蠕蟲和殭屍展開了大規模破壞和對落日軍團的屠殺。伊琳娜和僅存的落日軍團憤怒地殺死了巨噬蠕蟲,而道格拉斯認為他們還算有點用處,暫時停下了對落日軍團的處置,讓他們繼續為其做事。但對於伊琳娜來說,落日軍團的成員就如同自己的家人一樣,這件事肯定不能草草了結的,因此她雖然表面上答應了道格拉斯的指令,但內心已經在醞釀著反抗道格拉斯。
在梅麗莎加入到隊伍中後,一次偶然的機會,大衛等人突然收到了疑似是安娜的無線電通訊,通訊的另一頭表示,她會加入到大衛一行人的隊伍中,前提是要來到指定的位置幫助她摧毀一處柯羅諾斯的秘密設施。只是大衛放心不下身邊的燻,因此多米尼克和艾琳接過了這個任務,代替他們前往指定坐標。
在潛入設施後,他們又一次遇到了伊琳娜,心煩氣躁的伊琳娜駕駛著機甲試圖剷除多米尼克一行人,但最終還是寡不敵眾被二人擊敗,此時二人恰巧又遇上了同樣在搜査安娜下落的夢瑤,雖然沒有逮到安娜,但夢瑤將伊琳娜帶離了現場。與此同時,多米尼克和艾琳通關安娜的指示成功摧毀了此處的柯羅諾斯設施,但爆炸產生的能量擾亂了時空,將眾人傳送到了一處異世界村莊,並且發現及消滅了一隻被封印的異次元怪物。
實際上,道格拉斯並非憑空變出這些誇張的超時空技術,從異世界而來的埃希婭和諾克斯曾嘗試尋找回到異世界的方法,道格拉斯利用她們的這個想法得到了她們的協助,然而這項研究被安娜秘密發現,並最終在多米尼克和艾琳等人的協助下化為泡影。
柯羅諾斯設施爆炸後,道格拉斯的計畫浮出水面,而柯羅諾斯公司也遭到了大規模調查。與此同時,在得知了落日軍團的遭遇和伊琳娜想要復仇的決心後,夢瑤說服了伊琳娜加入到他們的隊伍中為落日軍團復仇,她們一同策反了落日軍團,並且在此次事件後公佈了有關道格拉斯的一切真相,導致曾經與道格拉斯友好的組織和人物都與他撇清了關係。而道格拉斯在被公開打上罪犯的罪名並遭到通緝後,諾克斯也和他斷絕了往來。而道格拉斯不願意承認這是他的結局,因此決定率領自己的超級戰士軍團正式向全世界開戰。
在開戰之後,道格拉斯首先瞄準的目標,就是一直以來在試圖和他作對的Aegis研究所。他派出了超重裝火神和大量喪屍襲擊了Aegis研究所的核心設施,為了奪回設施,索伊和傑西卡親臨前線,在突破重重障礙後擊敗了超重裝火神,成功奪回了研究設施。
在成功奪回核心設施後,索伊解析了一下之前的超重裝火神的數據,並成功鎖定了一處柯羅諾斯旗下的秘密工廠,而這個工廠在試圖大量製造包含XT-300和超重裝火神在內的機械兵器。然而索伊等人需要在這裡對設施進行維護,而Aegis研究所被重創後一時半會也派不出人手,無奈之下只能尋找外援。
幸運的是,卡里託的部隊響應了索伊的請求,根據索伊提供的坐標發現了秘密工廠。在伊琳娜的幫助下成功滲透到了XT-300的生產線,並在安吉拉的暗中協助下摧毀了生產線,並破壞了工廠內所有的超重裝火神。為了報答他們,安吉拉向他們透露了某個秘密研究設施的坐標,並且表示道格拉斯似乎在醞釀什麼危險的計畫。
為了阻止道格拉斯,多米尼克和艾琳根據坐標前往秘密研究設施,在察覺到這裡是用於研究超級戰士的設施之一後,二人將研究設施內的所有設備全部摧毀。
在來到研究設施外圍後,二人遭到了超級戰士之一的烈焰焚燼者的襲擊,雖然成功重傷了烈焰焚燼者,但它卻突然逃離了戰場。艾琳想要立刻追蹤烈焰焚燼者,但多米尼克決定先聯繫索伊讓她瞭解一下這裡的情況,而在戰場上出現的奇怪容器,多米尼克認為有必要優先對其內部裝載的物質進行調查。
經過一段時間的追蹤,索伊成功在一座城市內定位到了烈焰焚燼者,但它現在正在胡亂破壞沿途的一切事物,因此索伊派遣了距離烈焰焚燼者最近的傑拉德和吉姆,前往烈焰焚燼者所在的區域將其徹底擊敗。
雖然烈焰焚燼者一路在狂轟濫炸阻礙傑拉德和吉姆,但他們最終還是在一片商業區中心追蹤到並徹底擊敗了烈焰焚燼者。但烈焰焚燼者臨死前將自身的所有能量發散出來引發了大爆炸,將傑拉德和吉姆等人炸下了下水道。
雖然這場爆炸沒有把傑拉德和吉姆等人炸死,但二人不得不在地下區域尋找通往地面的出口。但在搜査的過程中,他們發現地下的構造和設施過於違和,而且剛才烈焰焚燼者的行為也有點可疑:與其說是在城市中破壞,不如說是故意把他們引到特定位置的陷阱。
隨後,他們在行進過程中,意外發現了隱藏在地下設施的其中一個Rex實驗室,甚至在這個實驗室中讀取到了和燻有關的超級戰士資料。吉姆認為這或許是能夠為她開發出解藥的關鍵線索,不過傑拉德還是決定先把資料拷貝下來,等出去以後再說。
在前進的路上,傑拉德有了一種猜測:如果說像這種隱藏起來的包含超級戰士資料的Rex實驗室在其他地方也存在,那麼道格拉斯肯定不希望在這種與全世界開戰的情況下被別人發現,而烈焰焚燼者很可能就是因為收到了摧毀這處設施的命令,加上道格拉斯十分希望削減Aegis研究所的戰鬥力,才會不斷在城市中搞破壞,吸引傑拉德他們的注意力。
隨後,傑拉德發現了一個能夠驗證他想法的地方——在另一處實驗室內,傑拉德等人從設施內回收了大量資料,其中不僅包含了Rex博士對超級戰士計畫的研究資料,更有一部分信息能夠幫助他們直接查找道格拉斯·雅各布本人的所在位置。
但是,似乎是因為察覺到烈焰焚燼者沒能成功摧毀設施,道格拉斯派遣了另一個名叫空中霸主的超級戰士伏擊了傑拉德和吉姆等人。不過,這名超級戰士也沒能阻擋住傑拉德和吉姆的步伐。隨後,傑拉德和吉姆決定立刻返回並將資料交給索伊。這些資料或許能夠在今後成為對抗道格拉斯的關鍵突破口。
(待補充)